按照《国家发展改革委关于调整南昆铁路货物临管运价的批复》(发改价格〔2006〕323号)的规定，南昆线、威红线执行的临管运价相应调整如下：
整车货物每吨公里0.1171元，自轮运转货物每轴公里0.3513元，整车农用化肥仍按有关规定执行;零担货物每10千克公里为0.001171元;集装箱货物每箱公里运价率分别为：1吨箱0.0703元， 20英尺箱2.342元，40英尺箱3.981元，空自备箱按重箱费率的40%计算。
按铁道部《关于明确农用化肥铁路运价优惠政策有关事项的通知》(铁运函〔2004〕364号)第二条“各类线路化肥运价”执行的化肥运价率每吨公里由“0.0706元”调整为“0.0726元”;其他国铁营业线和国铁控股合资铁路化肥运价，现执行每吨公里0.0706元的，调整为0.0726元。
从12月13日起，国家铁路部门有一次上调铁路货运价格，货物统一运价平均每吨公里由现行的9.61分提高至10.31分。其中，运营价格由平均每吨公里6.31分钱提高到7.01分钱，铁路建设基金维持现行每吨公里3.3分钱的标准不变。
2015年8月1日
国家发改委下发《关于调整铁路货运价格进一步完善价格形成机制的通知》，适当调整铁路货物运输价格，由平均每吨公里14.51分钱提高到15.51分钱，并作为基准价，允许适当上浮，上浮幅度最高不超过10%，下浮仍不限，运价上浮政策自2015年8月1日起实行。
现行铁路货运运费价格
办理
类别
货价号发到基价 运行基价
单 位 标 准单 位标 准
整
车1元 / 吨4.60元 / 吨公里0.0212
2元 / 吨5.40元 / 吨公里0.0243
3元 / 吨6.20元 / 吨公里0.0284
4元 / 吨7.00元 / 吨公里0.0319
5元 / 吨7.90元 / 吨公里0.0360
6元 / 吨8.50元 / 吨公里0.0390
7元 / 吨9.60元 / 吨公里0.0437
8元 / 吨10.70元 / 吨公里0.0490
9元 / 吨公里0.1500
冰保元 / 吨8.30元 / 吨公里0.0455
机保元 / 吨9.80元 / 吨公里0.0675
零
担21元 / 吨0.087元 / 吨公里0.000365
22元/10千克0.104元/10千克公里0.000438
23元/10千克0.125元/10千克公里0.000526
24元/10千克0.150元/10千克公里0.000631
集
装
箱1吨箱元 / 箱7.40元 / 箱公里0.00329
5.6吨箱元 / 箱57.00元 / 箱公里0.2525
10吨箱元 / 箱86.20元 / 箱公里0.3818
20英尺箱元 / 箱161.00元 / 箱公里0.7128
40英尺箱元 / 箱314.70元 / 箱公里1.3935
