厦航及其授权地面服务代理人一般不迟于客票上列明的航班离站时间前90分钟开始办理乘机手续;在航班离站时间前30分钟时(海口美兰机场、昆明长水机场、郑州新郑机场、杭州萧山机场40分钟，沈阳桃仙机场、广州白云机场、深圳宝安机场、北京首都机场、上海虹桥机场、浦东机场45分钟)停止办理乘机手续。
自2009年12月1日起，厦航所有航班提前十分钟关舱门/登机口(即关舱门/登机口的时间调整为计划起飞时间之前10分钟)，旅客应在合理时限内到达机场，凭客票及本人有效身份证件办妥乘机手续。旅客未能按时到达厦航的乘机登记处或登机门，或未能出示其有效身份证件及客票、登机牌，或未能做好旅行准备，厦航为不延误航班可取消旅客已定妥的座位。对旅客由此所产生的损失和费用，厦航不承担责任。
【航班起飞前60-150分钟前停止办理。暂不办理国际航班。】厦门 每日10:00后可办理次日从厦门始发国内航班的乘机手续
成都 每日10:00后可办理次日从成都始发国内航班的乘机手续
长沙 每日21:00后可办理次日从长沙始发国内航班的乘机手续
南京 每日13:00后可办理次日从南京始发国内航班的乘机手续
青岛 每日12:00后可办理次日从青岛始发国内航班的乘机手续
济南 每日12:00后可办理次日从济南始发国内航班的乘机手续
天津 每日16:00后可办理次日从天津始发国内航班的乘机手续
重庆 每日22:00后可办理次日从重庆始发国内航班的乘机手续
福州 每日10:00后可办理次日从福州始发国内航班的乘机手续
广州 每日22:00后可办理次日从广州始发国内航班的乘机手续
杭州 每日08:00后可办理次日从杭州始发国内航班的乘机手续
泉州 每日10:00后可办理次日从泉州机场始发国内航班的乘机手续
武汉 每日14:00后可办理次日从武汉始发国内航班的乘机手续
武夷山 每日12:00后可办理次日从武夷山始发国内航班的乘机手续
西安 每日21:00后可办理次日从西安始发国内航班的乘机手续
郑州 可办理当日从郑州始发的厦航国内航班的网上乘机手续
大连 每日21:00后可办理次日从大连始发国内航班的乘机手续
深圳 每日10:00后可办理次日从深圳始发国内航班的乘机手续
舟山 每日17:00后可办理次日从舟山始发国内航班的乘机手续
南昌 每日21:00后可办理次日从南昌始发国内航班的乘机手续
桂林 每日12:00后可办理当日从桂林始发国内航班的乘机手续
上海虹桥 每日17:00后可办理次日从上海机场始发国内航班的乘机手续
上海浦东 可办理当日从上海浦东始发的厦航国内航班的网上乘机手续，航班起飞前45分钟停止办理
北京 每日12:00后可办理次日所有从北京首都国际机场2号航站楼始发国内航班的乘机手续
宁波 每日20:00开放明日上午从宁波始发的厦航国内航班;当日早上开放下午航班的网上乘机手续，航班起飞前120分钟停止办理
