1号线首批开建的三个标段中共有4个地铁站，根据此前合肥市规划局公示的合肥市轨道交通1号线工程(合肥站-大东门站)设计方案，合肥站、大东门站为换乘站，凤阳路站、明光路站则为1号线的标准站。其中两座标准站均为地下二层设计，负一层为站厅层，负二层为站台层。
合肥站为1号线与3号线的换乘站，1号线为地下两层、一岛两侧站台，3号线为地下三层岛式站台。也就是说，1号线两个方向的列车中间有岛式站台，然后在两个方向的外侧另加了一个侧式站台，这样，旅客可以从中间岛式站台上下车，也可以从旁边的侧式站台上下车。3号线站台则包括站厅层、设备层、站台层。而且合肥站还有一条通道，直接通往火车站内，到时候，乘客下了火车，不出站就能直接转乘地铁。
大东门站为1号线与2号线的换乘站，也是此次公示的4座站台中唯一一座地下四层站台结构的，自上而下的第一层为“交通层”，主要用来满足行人过街、换乘及与周边的联系。
下面的几层则与其它站台的设计基本相同，为站厅层、设备层、站台层。
之所以会多出一层，是因为考虑到桥梁的安全，为了尽量不破坏桥墩，需要从南淝河河底穿过。但坡度太大会影响列车的行进，所以大东门站比其它地铁站都要深，这样就多出了一层空间。
至于未来各个地铁站里会分布什么样的商业，需要等到运营前的招商后才能最终确定，不过相关人士表示，已经考虑到地铁站未来商业文化氛围的营造，另外，合肥的地铁站充分考虑到与周边商圈的有效衔接，像大东门站，未来会更进一步融入到周边的商圈，有些出入口可以直接连通商业广场。
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